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瓊脂糖凝膠電泳注意事項及操作流程
更新時(shí)間:2021-08-26 點(diǎn)擊次數:4053

那么下面上海金鵬分析儀器有限公司為大家簡(jiǎn)單介紹一下關(guān)于瓊脂糖凝膠電泳注意事項及操作流程:

凝膠電泳操作注意事項:

1. 緩沖系統:在沒(méi)有離子存在時(shí),電導率*小,DNA不遷移,或遷移極慢,在高離子強度的緩沖液中,電導很高并產(chǎn)熱,可能導致DNA變性,因此應注意緩沖液的使用是否正確。長(cháng)時(shí)間高壓電泳時(shí),常更新緩沖液或在兩槽間進(jìn)行緩沖液的循環(huán)是可取的。

2. 瓊脂糖:不同廠(chǎng)家、不同批號的瓊脂糖,其雜質(zhì)含量不同,影響DNA的遷移及熒光背景的強度,應有選擇地使用。

3. 凝膠的制備:凝膠中所加緩沖液應與電泳槽中的相一致,溶解的凝膠應及時(shí)倒入板中,避免倒入前凝固結塊。倒入板中的凝膠應避免出現氣泡,影響電泳結果。

4. 樣品加入量:一般情況下,0.5cm寬的梳子可加0.5ug的DNA量,加樣量的多少依據加樣孔的大小及DNA中片段的數量和大小而定,過(guò)多的量會(huì )造成加樣孔超載,從而導致拖尾和彌散,對于較大的DNA此現象更明顯。

5. 電泳系統的變化會(huì )影響DNA的遷移,加入DNA標準參照物進(jìn)行判定是必要的。

6. DNA樣品中鹽濃度會(huì )影響DNA的遷移率,平行對照樣品應使用同樣的緩沖條件以消除這種影響。

7. DNA遷移率取決于瓊脂糖凝膠的濃度,遷移分子的形狀及大小。采用不同濃度的凝膠有可能分辨范圍廣泛的DNA分子,制備瓊脂糖凝膠可根據DNA分子的范圍來(lái)決定凝膠的濃度。小片段的DNA電泳應采用聚丙烯酰胺凝膠電泳以提高分辨率。

 

瓊脂糖加樣時(shí)候注意事項:

1、 用移液搶將樣品加至點(diǎn)樣孔。每孔點(diǎn)樣的體積一般少于25ul,因此吸取每一個(gè)樣品時(shí),操作要穩當且細心。

2、 常加一定量的蔗糖來(lái)增加樣品的濃度,以使每個(gè)樣品停留在各自的點(diǎn)樣孔中。

3、 在樣品中加入水溶性的陰離子追蹤染料(如溴酚藍),用以看出樣品移動(dòng)的距離。

4、 在一個(gè)或幾個(gè)孔中加入標準分子質(zhì)量樣品,電泳結束后,根據已知分子質(zhì)量的帶的相應位置可用來(lái)做出標準曲線(xiàn)。

5、 電泳一般是在追蹤染料泳動(dòng)到膠的80%部位時(shí)停止。注意電泳期間,電泳槽蓋要安全蓋好,以防止液體蒸發(fā),又可以降低電擊的可能性。

6、 電泳結束后,將膠浸沒(méi)在1mg/L的溴化乙錠(EB)中,5min后即可看到DNA帶,EB通過(guò)插入在雙螺旋的配對核苷酸之間同NDA結合。另一種方法是電泳時(shí),在膠中加入EB。

7、 在紫外燈下,由于EB發(fā)出強烈的橘紅色的熒光,所以可以看到DNA帶。利用這種方法檢測的界限是每條帶約10ng DNA。帶上塑料安全眼鏡可防止紫外光對眼睛的傷害??捎贸咦觼?lái)測量每條帶至點(diǎn)樣孔的距離。同樣,利用特制的照相機和調焦器,也可以對凝膠拍照。

8、 如果要對某一條帶(如質(zhì)粒)進(jìn)一步分析,可用小刀將含該帶的凝膠切割下來(lái),從帶中回收DNA。

 

瓊脂糖核酸電泳實(shí)驗操作流程

1.用蒸餾水將制膠模具和梳子沖洗干凈,放在制膠平板上,封閉模具邊緣,架好梳子;

2.根據欲分離DNA片段大小用凝膠緩沖液配制適宜濃度的瓊脂糖凝膠:準確稱(chēng)量瓊脂糖干粉,加入到配膠用的三角燒瓶?jì)?,定量加入電泳緩沖液(一般20~30 ml);

3.放入到微波爐內加熱熔化。冷卻片刻,加入一滴熒光染料,輕輕旋轉以充分混勻凝膠溶液,倒入電泳槽中,待其凝固;

4.室溫下30~45分鐘后凝膠*凝結,小心拔出梳子,將凝膠安放在電泳槽內;

5.向電泳槽中倒入電泳緩沖液,其量以沒(méi)過(guò)膠面1mm為宜,如樣品孔內有氣泡,應設法除去;

6.在DNA樣品中加入10×體積的載樣緩沖液(loading buffer),混勻后,用槍將樣品混合液緩慢加入被浸沒(méi)的凝膠加樣孔內;

7.接通電源,紅色為正極,黑色為負極,切記DNA樣品由負極往正極泳動(dòng) (靠近加樣孔的一端為負)。一般60~100V電壓,電泳20~40min即可;

8. 根據指示劑泳動(dòng)的位置,判斷是否終止電泳;

9.電泳完畢,關(guān)上電源,在凝膠成像儀上觀(guān)察電泳帶及其位置,并與核酸分子量標準Marker比較被擴增產(chǎn)物的大小。 

瓊脂糖凝膠濃度與線(xiàn)形DNA的*佳分辨范圍

瓊脂糖凝膠濃度線(xiàn)形DNA的*佳分辨范圍(bp)

0.5%1,000~30,000

0.7%800~12,000

1.0%500~10,000

1.2%400~7,000

1.5%200~3,000

2.0%50~2,000

 

以上就是上海金鵬分析儀器有限公司為大家整理總結關(guān)于瓊脂糖凝膠電泳注意事項及操作流程。

 

我們上海金鵬分析儀器有限公司是專(zhuān)業(yè)生產(chǎn)超微量核酸蛋白測定儀、化學(xué)發(fā)光成像系統、凝膠成像分析系統、紫外分析儀、核酸蛋白檢測儀、紫外檢測儀、蛋白質(zhì)分離純化系統、光化學(xué)反應儀、旋渦混合器、恒流泵、自動(dòng)部分收集器等十幾個(gè)系列產(chǎn)品的廠(chǎng)家,歡迎大家前來(lái)訂購


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